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磷酸基團與磷酸的區別在于：
一、磷酸是一種獨立存在的物質。
二、磷酸基團是通過化學鍵連接在其他物質上時的磷酸，磷酸基團是不能獨立存在的。
三、dna與atp中叫法不同是因為：dna穩定，dna上的磷酸一直存在于dna上，只有一種形態，無需多種叫法，稱之為磷酸即可（也可叫做磷酸基團）。
四、atp不穩定，apt上的磷酸易水解，這時磷酸基團就會變成磷酸，為了方便學習，所以這里叫法分開了。
擴展資料：
物質結構
正磷酸是由一個單一的磷氧四面體構成的磷酸。在磷酸分子中P原子是sp3雜化的，3個雜化軌道與氧原子間形成3個σ鍵，另一個P—O鍵是由一個從磷到氧的σ配鍵和兩個由氧到磷的d-pπ鍵組成的。σ配鍵是磷原子上的一對孤對電子向氧原子的空軌道配位而形成。
d←p配鍵是氧原子的py、pz軌道上的兩對孤對電子和磷原子的dxz、dyz空軌道重疊而成。由于磷原子3d能級比氧原子的2p能級能量高很多，組成的分子軌道不是很有效的，所以P—O鍵從數目上來看是三重鍵，但從鍵能和鍵長來看是介于單鍵和雙鍵之間。
純H3PO4和它的晶體水合物中都有氫鍵存在，這可能是磷酸濃溶液之所以粘稠的原因。
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